Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP6AP1Q15904 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP6AP1Q15904 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms