Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms