Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIX1Q15475 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIX1Q15475 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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