Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB35Q15286 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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RAB35Q15286 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RAB35Q15286 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RAB35Q15286 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RAB35Q15286 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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RAB35Q15286 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB35Q15286 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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