Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NKX1-1Q15270 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-1Q15270 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms