Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NECTIN1Q15223 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NECTIN1Q15223 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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