Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDGFRLQ15198 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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