Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms