Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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