Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC1Q13547 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC1Q13547 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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