Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3B2Q13367 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP3B2Q13367 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms