Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM28Q13263 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM28Q13263 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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