Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms