Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CALCOCO2Q13137 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CALCOCO2Q13137 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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