Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP4Q13115 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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