Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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