Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXD4Q12950 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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