Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SCAPQ12770 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms