Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 MTC4YBR255W 2085 nt3.78□□□□□ -1.8
LDB19Q12502 UBP14YBR058C 2346 nt3.78□□□□□ -1.8
LDB19Q12502 MCM7YBR202W 2538 nt3.78□□□□□ -1.8
LDB19Q12502 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt3.77□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 SEG1YMR086W 2883 nt3.77□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 PTP3YER075C 2787 nt3.76□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 SWI5YDR146C 2130 nt3.76□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 INP53YOR109W 3324 nt3.76□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 IFH1YLR223C 3258 nt3.76□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 FUN30YAL019W 3396 nt3.76□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 SWH1YAR042W 3567 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 YPP1YGR198W 2454 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 PHM6YDR281C 315 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 TRS120YDR407C 3870 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 APL2YKL135C 2181 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 CRM1YGR218W 3255 nt3.75□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 YCG1YDR325W 3108 nt3.74□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 YLR041WYLR041W 321 nt3.74□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 RPB2YOR151C 3675 nt3.74□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 BNI4YNL233W 2679 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.73□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 STE23YLR389C 3084 nt3.72□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 EMC1YCL045C 2283 nt3.72□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 SSM4YIL030C 3960 nt3.72□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 YDR210WYDR210W 228 nt3.72□□□□□ -1.81
LDB19Q12502 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.71□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.71□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 PSK2YOL045W 3306 nt3.71□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 MLH1YMR167W 2310 nt3.71□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 TRK1YJL129C 3708 nt3.7□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 SPT4YGR063C 309 nt3.7□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 PKH1YDR490C 2301 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 ATG11YPR049C 3537 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 CPA2YJR109C 3357 nt3.69□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 NAM7YMR080C 2916 nt3.68□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YLR232WYLR232W 348 nt3.68□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt3.68□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 MET10YFR030W 3108 nt3.68□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 SYT1YPR095C 3681 nt3.67□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 ALK1YGL021W 2283 nt3.67□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 KAP95YLR347C 2586 nt3.67□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 PRP22YER013W 3438 nt3.67□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 PTP2YOR208W 2253 nt3.67□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 ORC1YML065W 2745 nt3.66□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 MTR4YJL050W 3222 nt3.65□□□□□ -1.82
LDB19Q12502 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 CRS5YOR031W 210 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 ARO1YDR127W 4767 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 MYO3YKL129C 3819 nt3.65□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 YPR022CYPR022C 3402 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 ANB1YJR047C 474 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 SNC1YAL030W 354 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 POL3YDL102W 3294 nt3.64□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 DNL4YOR005C 2835 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 TAH1YCR060W 336 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 snR76snR76 109 nt3.63□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 ITC1YGL133W 3795 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 YOR296WYOR296W 3870 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 CHD1YER164W 4407 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 IRR1YIL026C 3453 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 CHS3YBR023C 3498 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 POM152YMR129W 4014 nt3.62□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 INP52YNL106C 3552 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 RRP12YPL012W 3687 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 MAK21YDR060W 3078 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 SRO77YBL106C 3033 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 YTA7YGR270W 4140 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 SWI1YPL016W 3945 nt3.61□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 APE2YKL157W 2859 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 FLO5YHR211W 3228 nt3.6□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 SPT6YGR116W 4356 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 SIN3YOL004W 4611 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 PNC1YGL037C 651 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt3.59□□□□□ -1.83
LDB19Q12502 RGA2YDR379W 3030 nt3.59□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 BRE1YDL074C 2103 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 NPR3YHL023C 3441 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 EAF1YDR359C 2949 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 NEW1YPL226W 3591 nt3.58□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 YME2YMR302C 2553 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 CHS2YBR038W 2892 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 RPL37BYDR500C 267 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 RAD26YJR035W 3258 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 TMA108YIL137C 2841 nt3.57□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 ZDS2YML109W 2829 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 YGL140CYGL140C 3660 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 CHO2YGR157W 2610 nt3.56□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 KTI11YBL071W-A 249 nt3.55□□□□□ -1.84
LDB19Q12502 RIC1YLR039C 3171 nt3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.5 ms