Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 YOP1YPR028W 543 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 MSC6YOR354C 2079 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 LYS14YDR034C 2373 nt1.93□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 SEC63YOR254C 1992 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 RIM20YOR275C 1986 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 TOR2YKL203C 7425 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 TDA9YML081W 3756 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 YEL057CYEL057C 702 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 YHL037CYHL037C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 RPL38YLR325C 237 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 SEY1YOR165W 2331 nt1.92□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 MUK1YPL070W 1839 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 NOP14YDL148C 2433 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 STH1YIL126W 4080 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 RPL35AYDL191W 363 nt1.91□□□□□ -2.1
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TY2A-OR1Q12439 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 YDR413CYDR413C 576 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2A-OR1Q12439 SEC31YDL195W 3822 nt1.91□□□□□ -2.1
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TY2A-OR1Q12439 NEO1YIL048W 3456 nt1.9□□□□□ -2.1
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TY2A-OR1Q12439 HMI1YOL095C 2121 nt1.9□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 SPP41YDR464W 4308 nt1.89□□□□□ -2.11
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TY2A-OR1Q12439 MSH5YDL154W 2706 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 MYO4YAL029C 4416 nt1.89□□□□□ -2.11
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TY2A-OR1Q12439 RLM1YPL089C 2031 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 FRK1YPL141C 2598 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 YER097WYER097W 330 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2A-OR1Q12439 TAR1YLR154W-C 375 nt1.88□□□□□ -2.11
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TY2A-OR1Q12439 PCC1YKR095W-A 267 nt1.87□□□□□ -2.11
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TY2A-OR1Q12439 TMA7YLR262C-A 195 nt1.83□□□□□ -2.12
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TY2A-OR1Q12439 ELG1YOR144C 2376 nt1.79□□□□□ -2.12
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TY2A-OR1Q12439 UBR2YLR024C 5619 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2A-OR1Q12439 YGL149WYGL149W 306 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2A-OR1Q12439 YLR255CYLR255C 354 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2A-OR1Q12439 UTP21YLR409C 2820 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2A-OR1Q12439 LHS1YKL073W 2646 nt1.78□□□□□ -2.12
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TY2A-OR1Q12439 SFB2YNL049C 2631 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 ENV11YGR071C 2583 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 HTL1YCR020W-B 237 nt1.77□□□□□ -2.13
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TY2A-OR1Q12439 YJL135WYJL135W 318 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YAR029WYAR029W 225 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YOL160WYOL160W 342 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YMR045CYMR045C 5268 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 PIG1YLR273C 1947 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.76□□□□□ -2.13
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TY2A-OR1Q12439 APL2YKL135C 2181 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YNL144CYNL144C 2223 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 ZIP2YGL249W 2115 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 snR65snR65 100 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 TBS1YBR150C 3285 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YIL102CYIL102C 306 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2A-OR1Q12439 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.74□□□□□ -2.13
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