Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.03□□□□□ -2.4
RTR2Q12378 RPS7BYNL096C 573 nt0.03□□□□□ -2.4
RTR2Q12378 snR45snR45 172 nt0.03□□□□□ -2.4
RTR2Q12378 KAR1YNL188W 1302 nt0.03□□□□□ -2.4
RTR2Q12378 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.03□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 RPL26BYGR034W 384 nt0.02□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.02□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YPR153WYPR153W 423 nt0.02□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 MLP2YIL149C 5040 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 MMS4YBR098W 2076 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 ALY2YJL084C 3141 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 RSM18YER050C 417 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 THG1YGR024C 714 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 SWI5YDR146C 2130 nt0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 NTF2YER009W 378 nt0□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 COX12YLR038C 252 nt0□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 GSP1YLR293C 660 nt0□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 NPR2YEL062W 1848 nt-0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YGR042WYGR042W 816 nt-0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YJL086CYJL086C 369 nt-0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.01□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 VIK1YPL253C 1944 nt-0.02□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 LCD1YDR499W 2244 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 SLY1YDR189W 2001 nt-0.03□□□□□ -2.41
RTR2Q12378 MET32YDR253C 576 nt-0.04□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 YOR282WYOR282W 321 nt-0.04□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.05□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 HNT1YDL125C 477 nt-0.05□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 YPL080CYPL080C 327 nt-0.05□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 LOA1YPR139C 903 nt-0.05□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 ARV1YLR242C 966 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 IRC13YOR235W 315 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 COG8YML071C 1824 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 PRP5YBR237W 2550 nt-0.07□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 SPC24YMR117C 642 nt-0.07□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 NOP9YJL010C 2001 nt-0.08□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 VPS63YLR261C 327 nt-0.08□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 YOR053WYOR053W 342 nt-0.09□□□□□ -2.42
RTR2Q12378 YDR114CYDR114C 303 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YGL204CYGL204C 306 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 UPS1YLR193C 528 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YAR053WYAR053W 297 nt-0.1□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 PET111YMR257C 2403 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YDL152WYDL152W 366 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YLR232WYLR232W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 RRT1YBL048W 312 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 ATP20YPR020W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 MRPL50YNR022C 420 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 RCN2YOR220W 798 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YOR366WYOR366W 354 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 ATC1YDR184C 885 nt-0.13□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 PSF2YJL072C 642 nt-0.13□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.13□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 SPO23YBR250W 1572 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 TAH1YCR060W 336 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 RPL9AYGL147C 576 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 CMS1YLR003C 876 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YLR252WYLR252W 306 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 RPL26AYLR344W 384 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 RPL32YBL092W 393 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 snR190snR190 190 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.14□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.15□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 BIG1YHR101C 1008 nt-0.15□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 ENV11YGR071C 2583 nt-0.15□□□□□ -2.43
RTR2Q12378 snR79snR79 84 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 ULI1YFR026C 510 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 VMA21YGR105W 234 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 snR44snR44 211 nt-0.17□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 CSE1YGL238W 2883 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 snR84snR84 550 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 SSS1YDR086C 243 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 SPO11YHL022C 1197 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 MLP1YKR095W 5628 nt-0.18□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 RMD6YEL072W 696 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 YHL042WYHL042W 453 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 DFG10YIL049W 762 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 GIM5YML094W 492 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 IPI3YNL182C 1668 nt-0.19□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 YDR344CYDR344C 444 nt-0.2□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 RPL35AYDL191W 363 nt-0.21□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 FYV10YIL097W 1551 nt-0.21□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 PRP42YDR235W 1635 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 YDR008CYDR008C 351 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 RUB1YDR139C 234 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 GPX1YKL026C 504 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 BSC3YLR465C 309 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 COX7YMR256C 183 nt-0.22□□□□□ -2.44
RTR2Q12378 PAN3YKL025C 2040 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 MYO1YHR023W 5787 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTR2Q12378 snR59snR59 78 nt-0.23□□□□□ -2.45
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