Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 LYS14YDR034C 2373 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 DGR2YKL121W 2559 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YDL011CYDL011C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 SDH7YDR511W 402 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YIL059CYIL059C 366 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YJR157WYJR157W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 EFR3YMR212C 2349 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 PXA2YKL188C 2562 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 NUP192YJL039C 5052 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 SRP14YDL092W 441 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YDR114CYDR114C 303 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 EMC5YIL027C 426 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 COF1YLL050C 432 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YLR140WYLR140W 327 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 SPO23YBR250W 1572 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 AHC1YOR023C 1701 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN6Q12377 SLY1YDR189W 2001 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 SMC4YLR086W 4257 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YDR269CYDR269C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 PAU2YEL049W 363 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RTR1YER139C 681 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YJL022WYJL022W 309 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YAR047CYAR047C 321 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YOR376WYOR376W 369 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 SPC98YNL126W 2541 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 ALK1YGL021W 2283 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RAD50YNL250W 3939 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 MVP1YMR004W 1536 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 MRPL50YNR022C 420 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 AIM9YER080W 1884 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 UFD2YDL190C 2886 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 SAS3YBL052C 2496 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 CDC36YDL165W 576 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 WIP1YDR374W-A 270 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RPS24BYIL069C 408 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YJL015CYJL015C 285 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 UBC7YMR022W 498 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RPL9BYNL067W 576 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RFX1YLR176C 2436 nt1.25□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 MAD1YGL086W 2250 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 PRE4YFR050C 801 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YGR042WYGR042W 816 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YHL037CYHL037C 402 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 TIM18YOR297C 579 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 PRM3YPL192C 402 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YPL229WYPL229W 621 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RSM22YKL155C 1887 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YLL054CYLL054C 2532 nt1.24□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 PIG1YLR273C 1947 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 AGA2YGL032C 264 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 HIT1YJR055W 495 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YKL083WYKL083W 615 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 HCH1YNL281W 462 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YOL159CYOL159C 516 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RAD9YDR217C 3930 nt1.23□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 PCF11YDR228C 1881 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 SGO1YOR073W 1773 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YLL032CYLL032C 2478 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 NOC3YLR002C 1992 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 CYC7YEL039C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YGL217CYGL217C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 VPS55YJR044C 423 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 RPL40BYKR094C 387 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.22□□□□□ -2.21
RPN6Q12377 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 MRPL31YKL138C 396 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YKL202WYKL202W 582 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 RPL33BYOR234C 324 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 PMD1YER132C 5262 nt1.21□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 KIP1YBL063W 3336 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 AZF1YOR113W 2745 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 EST2YLR318W 2655 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 SDH2YLL041C 801 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YPL185WYPL185W 396 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 SLX4YLR135W 2247 nt1.2□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 KAP122YGL016W 3246 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 VPS54YDR027C 2670 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YAP6YDR259C 1152 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YML003WYML003W 873 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 MUK1YPL070W 1839 nt1.19□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 VAR1Q0140 1197 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 RPL26AYLR344W 384 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 RPB10YOR210W 213 nt1.18□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 SWF1YDR126W 1011 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 ISF1YMR081C 1017 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 NUT2YPR168W 474 nt1.17□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YDL211CYDL211C 1119 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YLR434CYLR434C 384 nt1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 204.4 ms