Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 SET2YJL168C 2202 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 HFM1YGL251C 3564 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YNL114CYNL114C 372 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 RAD5YLR032W 3510 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 SCH9YHR205W 2475 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 TOP1YOL006C 2310 nt3.92□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 PUT3YKL015W 2940 nt3.92□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 RPA135YPR010C 3612 nt3.92□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 PRP22YER013W 3438 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YFR016CYFR016C 3702 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 RPA190YOR341W 4995 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 SPT4YGR063C 309 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YPR022CYPR022C 3402 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 EXO84YBR102C 2262 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YMR317WYMR317W 3423 nt3.91□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YAT2YER024W 2772 nt3.9□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 MYO3YKL129C 3819 nt3.9□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 SMC3YJL074C 3693 nt3.9□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 BFR2YDR299W 1605 nt3.9□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt3.89□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 BUB1YGR188C 3066 nt3.89□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 COG6YNL041C 2520 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YME2YMR302C 2553 nt3.88□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 ITC1YGL133W 3795 nt3.87□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.87□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 PSK2YOL045W 3306 nt3.87□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 CCM1YGR150C 2595 nt3.87□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 UBP14YBR058C 2346 nt3.87□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 SPA2YLL021W 4401 nt3.86□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.86□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 EPL1YFL024C 2499 nt3.86□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YKU80YMR106C 1890 nt3.86□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 MET10YFR030W 3108 nt3.85□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt3.85□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 YHR080CYHR080C 4038 nt3.85□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 FAR1YJL157C 2493 nt3.84□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 RRP6YOR001W 2202 nt3.84□□□□□ -1.79
MSB4Q12317 BMS1YPL217C 3552 nt3.83□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 PTP3YER075C 2787 nt3.83□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 SET1YHR119W 3243 nt3.83□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 PHO81YGR233C 3537 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 ENA2YDR039C 3276 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 ENA1YDR040C 3276 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 BIR1YJR089W 2865 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 ASE1YOR058C 2658 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 YML002WYML002W 2214 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 URA2YJL130C 6645 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 KAP95YLR347C 2586 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 FUN30YAL019W 3396 nt3.82□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 ORC3YLL004W 1851 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 RGC1YPR115W 3252 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 SWI5YDR146C 2130 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 YEL025CYEL025C 3567 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 ORC1YML065W 2745 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 TTI1YKL033W 3117 nt3.81□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 RAD34YDR314C 2079 nt3.8□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 LHS1YKL073W 2646 nt3.8□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 RRP5YMR229C 5190 nt3.8□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 RPS21AYKR057W 264 nt3.8□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 snR47snR47 99 nt3.79□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 SQS1YNL224C 2304 nt3.79□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt3.78□□□□□ -1.8
MSB4Q12317 HEF3YNL014W 3135 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 NPR3YHL023C 3441 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 FAS1YKL182W 6156 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 STU2YLR045C 2667 nt3.77□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.76□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 CHS3YBR023C 3498 nt3.76□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 INP53YOR109W 3324 nt3.76□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 UBP11YKR098C 2154 nt3.76□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YDL206WYDL206W 2289 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 MAD1YGL086W 2250 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 CHO2YGR157W 2610 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 IFH1YLR223C 3258 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 MAK21YDR060W 3078 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 ECM21YBL101C 3354 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.75□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YLL020CYLL020C 306 nt3.74□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 NAM7YMR080C 2916 nt3.74□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 KAP120YPL125W 3099 nt3.74□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.73□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 SEC1YDR164C 2175 nt3.72□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 snR70snR70 164 nt3.72□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 MLH1YMR167W 2310 nt3.72□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 DNA2YHR164C 4569 nt3.72□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 RTT107YHR154W 3213 nt3.72□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 NOP9YJL010C 2001 nt3.71□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 SVL3YPL032C 2478 nt3.71□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 AUS1YOR011W 4185 nt3.71□□□□□ -1.81
MSB4Q12317 NOP10YHR072W-A 177 nt3.71□□□□□ -1.82
MSB4Q12317 BOI1YBL085W 2943 nt3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms