Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 RAD50YNL250W 3939 nt1.43□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YDL011CYDL011C 324 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 TIM18YOR297C 579 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YPR177CYPR177C 372 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YLL054CYLL054C 2532 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 PIG1YLR273C 1947 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 SLY1YDR189W 2001 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 SGO1YOR073W 1773 nt1.42□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 PET127YOR017W 2403 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 FYV8YGR196C 2454 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 PRE4YFR050C 801 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 RTT102YGR275W 474 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 EFR3YMR212C 2349 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 RFX1YLR176C 2436 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 MSN5YDR335W 3675 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.41□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 IRA1YBR140C 9279 nt1.4□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 AZF1YOR113W 2745 nt1.4□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 YCS4YLR272C 3531 nt1.4□□□□□ -2.18
RPN5Q12250 GDS1YOR355W 1569 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SRP14YDL092W 441 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YDR269CYDR269C 324 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YGL217CYGL217C 342 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YPL205CYPL205C 345 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 PIK1YNL267W 3201 nt1.4□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 NOC3YLR002C 1992 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 KIP1YBL063W 3336 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 VPS54YDR027C 2670 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 CBS1YDL069C 690 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 RPL9BYNL067W 576 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 CDC31YOR257W 486 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SAS3YBL052C 2496 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 CAT8YMR280C 4302 nt1.39□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SLX4YLR135W 2247 nt1.38□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SEC21YNL287W 2808 nt1.38□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YLL032CYLL032C 2478 nt1.38□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 HKR1YDR420W 5409 nt1.37□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 MRPL50YNR022C 420 nt1.37□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YSY6YBR162W-A 198 nt1.37□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 NUT1YGL151W 3399 nt1.37□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 AIM9YER080W 1884 nt1.37□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 NUP192YJL039C 5052 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 POL5YEL055C 3069 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 WIP1YDR374W-A 270 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SDH7YDR511W 402 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YKL202WYKL202W 582 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 MUK1YPL070W 1839 nt1.36□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 MRPL31YKL138C 396 nt1.35□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.35□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 UBC7YMR022W 498 nt1.35□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 CLU1YMR012W 3834 nt1.35□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YDL211CYDL211C 1119 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YHL037CYHL037C 402 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YJR157WYJR157W 363 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 SDH2YLL041C 801 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 VPS20YMR077C 666 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 YPL229WYPL229W 621 nt1.34□□□□□ -2.19
RPN5Q12250 APL2YKL135C 2181 nt1.34□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 ENV11YGR071C 2583 nt1.33□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YNL324WYNL324W 396 nt1.33□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 CDC25YLR310C 4770 nt1.33□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.33□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 RSM22YKL155C 1887 nt1.33□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 CYC7YEL039C 342 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 RPS24BYIL069C 408 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 RRT15YLR162W-A 189 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YAR047CYAR047C 321 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YML003WYML003W 873 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 HCH1YNL281W 462 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 NUT2YPR168W 474 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 SEC3YER008C 4011 nt1.32□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 SWI4YER111C 3282 nt1.31□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 UPS1YLR193C 528 nt1.3□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 SPT21YMR179W 2277 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 AIM44YPL158C 2277 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YPR063CYPR063C 423 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 SCW11YGL028C 1629 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 NUP188YML103C 4968 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 CDC36YDL165W 576 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YKL083WYKL083W 615 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YLL020CYLL020C 306 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YPL185WYPL185W 396 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 SPC98YNL126W 2541 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 MPT5YGL178W 2580 nt1.28□□□□□ -2.2
RPN5Q12250 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.27□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 YAP6YDR259C 1152 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
RPN5Q12250 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.3 ms