Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 AFB1YLR040C 675 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 GMC2YLR445W 567 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.52□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 NUP120YKL057C 3114 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 CYC7YEL039C 342 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 SCW11YGL028C 1629 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 PRM8YGL053W 714 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 PRP21YJL203W 843 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 TOF2YKR010C 2316 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 NBP1YLR457C 960 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 FIG4YNL325C 2640 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YOL029CYOL029C 606 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 IRC16YPR038W 360 nt0.51□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 PIG1YLR273C 1947 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 RKR1YMR247C 4689 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 RUF22RUF22 515 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YBR071WYBR071W 636 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 SLM6YBR266C 453 nt0.5□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 SET3YKR029C 2256 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 NUP157YER105C 4176 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 SLD3YGL113W 2007 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 STO1YMR125W 2586 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YDR008CYDR008C 351 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YIL029CYIL029C 429 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 LYS14YDR034C 2373 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 SPO23YBR250W 1572 nt0.49□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 COG4YPR105C 2586 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YPR039WYPR039W 336 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 CLU1YMR012W 3834 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 Q0255Q0255 1419 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 AIM44YPL158C 2277 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 VMA21YGR105W 234 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YAP3YHL009C 993 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 YBR012CYBR012C 420 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 PXA2YKL188C 2562 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 NUP145YGL092W 3954 nt0.47□□□□□ -2.33
CCW12Q12127 NUT1YGL151W 3399 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 NBL1YHR199C-A 222 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YDL206WYDL206W 2289 nt0.46□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 RIM20YOR275C 1986 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YDR114CYDR114C 303 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 MXR1YER042W 555 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YGR045CYGR045C 363 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YKL044WYKL044W 321 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 RPL32YBL092W 393 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.45□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YMR160WYMR160W 2451 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YDL196WYDL196W 330 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 SWF1YDR126W 1011 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 HIT1YJR055W 495 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 ILM1YJR118C 612 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 UBX4YMR067C 1251 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 UTP10YJL109C 5310 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YLL032CYLL032C 2478 nt0.44□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 SNU56YDR240C 1479 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YER135CYER135C 393 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 PHS1YJL097W 654 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 MRPL31YKL138C 396 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 UPS1YLR193C 528 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 IES4YOR189W 351 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YOR248WYOR248W 303 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 LCD1YDR499W 2244 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 SWI6YLR182W 2412 nt0.43□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 PDE2YOR360C 1581 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 OST1YJL002C 1431 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YDL016CYDL016C 303 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 HUR1YGL168W 333 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YJR141WYJR141W 1044 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YOR199WYOR199W 330 nt0.42□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 WAR1YML076C 2835 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 OCA6YDR067C 675 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 STF2YGR008C 255 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YGR025WYGR025W 303 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 YGR042WYGR042W 816 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
CCW12Q12127 BER1YLR412W 825 nt0.41□□□□□ -2.34
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