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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
TSC3
YBR058C-A
243 nt
1.18
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
CDC25
YLR310C
4770 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
TRM732
YMR259C
4263 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
ROM2
YLR371W
4071 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
SRP14
YDL092W
441 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
RPL9A
YGL147C
576 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
GAL7
YBR018C
1101 nt
1.17
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
APL1
YJR005W
2103 nt
1.16
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
MPT5
YGL178W
2580 nt
1.16
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
TTI1
YKL033W
3117 nt
1.16
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
YGR025W
YGR025W
303 nt
1.16
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
SAS3
YBL052C
2496 nt
1.15
□□□□□ -2.22
REX3
Q12090
HUR1
YGL168W
333 nt
1.15
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YGL239C
YGL239C
315 nt
1.15
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
RCN2
YOR220W
798 nt
1.15
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
EAF1
YDR359C
2949 nt
1.15
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
APL3
YBL037W
3078 nt
1.14
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
RTT102
YGR275W
474 nt
1.14
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
EAF6
YJR082C
342 nt
1.14
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YBR012C
YBR012C
420 nt
1.14
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
SPT7
YBR081C
3999 nt
1.14
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
COG4
YPR105C
2586 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
SLY1
YDR189W
2001 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YNL284C-B
YNL284C-B
5268 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YGR045C
YGR045C
363 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
SDH2
YLL041C
801 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
NUT2
YPR168W
474 nt
1.13
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
SIP4
YJL089W
2490 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
STF2
YGR008C
255 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
snR14
snR14
160 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
PXA2
YKL188C
2562 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YAR009C
YAR009C
3591 nt
1.12
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
STB6
YKL072W
2301 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
MDS3
YGL197W
4464 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YER023C-A
YER023C-A
213 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YBR076C-A
YBR076C-A
267 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
SCW11
YGL028C
1629 nt
1.11
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
RFX1
YLR176C
2436 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
EMC4
YGL231C
573 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YIL059C
YIL059C
366 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
GPI15
YNL038W
690 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YPL182C
YPL182C
384 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YLL032C
YLL032C
2478 nt
1.1
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
APL2
YKL135C
2181 nt
1.09
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
PBI2
YNL015W
228 nt
1.09
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YNR025C
YNR025C
360 nt
1.09
□□□□□ -2.23
REX3
Q12090
YCR001W
YCR001W
315 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
URM1
YIL008W
300 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RPS27A
YKL156W
249 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
UPS1
YLR193C
528 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RUF22
RUF22
515 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RPL32
YBL092W
393 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RPL33B
YOR234C
324 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
ALY2
YJL084C
3141 nt
1.08
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
ENV11
YGR071C
2583 nt
1.07
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YDR269C
YDR269C
324 nt
1.07
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YER135C
YER135C
393 nt
1.07
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YBR200W-A
YBR200W-A
165 nt
1.07
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
MMS4
YBR098W
2076 nt
1.06
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
MRPL31
YKL138C
396 nt
1.06
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
HUG1
YML058W-A
207 nt
1.06
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
KAP120
YPL125W
3099 nt
1.06
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YEL050W-A
YEL050W-A
192 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
NBL1
YHR199C-A
222 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RPL16A
YIL133C
600 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
PHS1
YJL097W
654 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
VAM6
YDL077C
3150 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
EFR3
YMR212C
2349 nt
1.05
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
STE18
YJR086W
333 nt
1.04
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
NUP157
YER105C
4176 nt
1.04
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
SET3
YKR029C
2256 nt
1.04
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
RIM20
YOR275C
1986 nt
1.03
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
YPR117W
YPR117W
7470 nt
1.03
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
PDE2
YOR360C
1581 nt
1.03
□□□□□ -2.24
REX3
Q12090
FIG4
YNL325C
2640 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YER087C-A
YER087C-A
552 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YIL066W-A
YIL066W-A
444 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YJR029W
YJR029W
5268 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YPR137C-B
YPR137C-B
5268 nt
1.02
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
LCD1
YDR499W
2244 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
SLI15
YBR156C
2097 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
CYC7
YEL039C
342 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
EMT1
tM(CAU)D
73 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
EMT5
tM(CAU)J1
73 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
EMT3
tM(CAU)J2
73 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
EMT4
tM(CAU)M
73 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
EMT2
tM(CAU)O2
73 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YHR130C
YHR130C
336 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
RPL34B
YIL052C
366 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
RRT1
YBL048W
312 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
HCH1
YNL281W
462 nt
1.01
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
STO1
YMR125W
2586 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YHR125W
YHR125W
306 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YHR139C-A
YHR139C-A
312 nt
1
□□□□□ -2.25
REX3
Q12090
YLR269C
YLR269C
351 nt
1
□□□□□ -2.25
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