Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.6□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 SEC5YDR166C 2916 nt2.6□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 SMC6YLR383W 3345 nt2.59□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.59□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.59□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 RPS17AYML024W 411 nt2.59□□□□□ -1.99
TMA46Q12000 TRS65YGR166W 1683 nt2.58□□□□□ -2
TMA46Q12000 YLR140WYLR140W 327 nt2.58□□□□□ -2
TMA46Q12000 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.58□□□□□ -2
TMA46Q12000 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.58□□□□□ -2
TMA46Q12000 PDR1YGL013C 3207 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 SRP14YDL092W 441 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 RPS27BYHR021C 249 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 YBL012CYBL012C 402 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 YOR376WYOR376W 369 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 SGF11YPL047W 300 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 SPO75YLL005C 2607 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 PHO2YDL106C 1680 nt2.57□□□□□ -2
TMA46Q12000 CLN3YAL040C 1743 nt2.56□□□□□ -2
TMA46Q12000 RAV1YJR033C 4074 nt2.56□□□□□ -2
TMA46Q12000 ATG11YPR049C 3537 nt2.56□□□□□ -2
TMA46Q12000 KRE33YNL132W 3171 nt2.56□□□□□ -2
TMA46Q12000 YKU70YMR284W 1809 nt2.56□□□□□ -2
TMA46Q12000 RPO41YFL036W 4056 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 NOP14YDL148C 2433 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 PRP39YML046W 1890 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 ARP8YOR141C 2646 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 YOR218CYOR218C 420 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 GIP3YPL137C 3831 nt2.55□□□□□ -2
TMA46Q12000 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.54□□□□□ -2
TMA46Q12000 TOR1YJR066W 7413 nt2.54□□□□□ -2
TMA46Q12000 HSH155YMR288W 2916 nt2.54□□□□□ -2
TMA46Q12000 YOR055WYOR055W 435 nt2.53□□□□□ -2
TMA46Q12000 CYR1YJL005W 6081 nt2.53□□□□□ -2
TMA46Q12000 TFC8YPL007C 1767 nt2.53□□□□□ -2
TMA46Q12000 TUS1YLR425W 3924 nt2.53□□□□□ -2
TMA46Q12000 EDS1YBR033W 2760 nt2.53□□□□□ -2
TMA46Q12000 ENV11YGR071C 2583 nt2.53□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 TRL1YJL087C 2484 nt2.52□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 ORC2YBR060C 1863 nt2.52□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 MLH1YMR167W 2310 nt2.52□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 COA4YLR218C 453 nt2.52□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 PUT3YKL015W 2940 nt2.52□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 MSC6YOR354C 2079 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 ZIP1YDR285W 2628 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YGL217CYGL217C 342 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 SPO21YOL091W 1830 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 CSF1YLR087C 8877 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 CHC1YGL206C 4962 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 RLM1YPL089C 2031 nt2.51□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 NAM7YMR080C 2916 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 PSD2YGR170W 3417 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YDR341CYDR341C 1824 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 ATP8Q0080 147 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 RPL34BYIL052C 366 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 MBB1YJL199C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 CAT2YML042W 2013 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 TRA1YHR099W 11235 nt2.49□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YJL120WYJL120W 324 nt2.49□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.49□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 ZIP2YGL249W 2115 nt2.48□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YRB1YDR002W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 BRP1YGL007W 378 nt2.48□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 ATP7YKL016C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 RAD34YDR314C 2079 nt2.48□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 RTT107YHR154W 3213 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 TIM9YEL020W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 RPS25BYLR333C 327 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YBR174CYBR174C 315 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 snR46snR46 197 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 MCM10YIL150C 1716 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 STE11YLR362W 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 SAS3YBL052C 2496 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 DCP2YNL118C 2913 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 SYH1YPL105C 2550 nt2.47□□□□□ -2.01
TMA46Q12000 MSH5YDL154W 2706 nt2.46□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.46□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 SLN1YIL147C 3663 nt2.45□□□□□ -2.02
TMA46Q12000 CDC60YPL160W 3273 nt2.45□□□□□ -2.02
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