Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CGNL1Q0VF96 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms