Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPAL4Q0D2K0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPAL4Q0D2K0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms