Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms