Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 451.8 ms