Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 FMP27YLR454W 7887 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 SLY1YDR189W 2001 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 URM1YIL008W 300 nt0.49□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 KAR1YNL188W 1302 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 ISD11YER048W-A 285 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 YKL111CYKL111C 336 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 SDH2YLL041C 801 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 PAC1YOR269W 1485 nt0.48□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 SLD3YGL113W 2007 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 QCR7YDR529C 384 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 LRP1YHR081W 555 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 YLR217WYLR217W 324 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 YBR071WYBR071W 636 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 YPR099CYPR099C 357 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 LYS14YDR034C 2373 nt0.47□□□□□ -2.33
ATG38Q05789 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YDR008CYDR008C 351 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 PAN3YKL025C 2040 nt0.46□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 LTE1YAL024C 4308 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 RSM27YGR215W 333 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 UPS1YLR193C 528 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 RPS30BYOR182C 192 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YPR153WYPR153W 423 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 LCD1YDR499W 2244 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 SWI6YLR182W 2412 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 ENV11YGR071C 2583 nt0.45□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 TAD1YGL243W 1203 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 INA22YIR024C 651 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 WAR1YML076C 2835 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 BI4Q0120 1917 nt0.44□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YPR170CYPR170C 336 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YSP1YHR155W 3687 nt0.43□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YIL059CYIL059C 366 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 HUG1YML058W-A 207 nt0.42□□□□□ -2.34
ATG38Q05789 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 RRT1YBL048W 312 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YJR003CYJR003C 1560 nt0.4□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YDR220CYDR220C 294 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 RPC10YHR143W-A 213 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YBL062WYBL062W 381 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.39□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 snR84snR84 550 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 MET32YDR253C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YGL015CYGL015C 393 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YOR218CYOR218C 420 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YOR282WYOR282W 321 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 SLI15YBR156C 2097 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 BIR1YJR089W 2865 nt0.37□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.36□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 ABF2YMR072W 552 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 YLL032CYLL032C 2478 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG38Q05789 BFR2YDR299W 1605 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 STE5YDR103W 2754 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YGR042WYGR042W 816 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 SPC2YML055W 537 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 AI1Q0050 2505 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 GEA2YEL022W 4380 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 CHS6YJL099W 2241 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 PMP1YCR024C-A 123 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YFR057WYFR057W 456 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 RPL9AYGL147C 576 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YPR096CYPR096C 303 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 SLX9YGR081C 633 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YPT6YLR262C 648 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YLR271WYLR271W 825 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 RPL26AYLR344W 384 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YOR248WYOR248W 303 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 NPC2YDL046W 522 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YGR115CYGR115C 780 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YHL042WYHL042W 453 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YGR228WYGR228W 345 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 MRPL31YKL138C 396 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 UBX4YMR067C 1251 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 RPL32YBL092W 393 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG38Q05789 MLP2YIL149C 5040 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG38Q05789 IQG1YPL242C 4488 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG38Q05789 GMC2YLR445W 567 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG38Q05789 CSM4YPL200W 471 nt0.27□□□□□ -2.37
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