Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GBE1Q04446 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms