Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 MLH3YPL164C 2148 nt1.36□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 SPO75YLL005C 2607 nt1.36□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 PAN3YKL025C 2040 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YER079WYER079W 633 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YJL015CYJL015C 285 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YLR287CYLR287C 1068 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YBL071CYBL071C 309 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 HHT1YBR010W 411 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YCL046WYCL046W 324 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 OSH6YKR003W 1347 nt1.35□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YBR184WYBR184W 1572 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 SDH7YDR511W 402 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 EMC5YIL027C 426 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 COF1YLL050C 432 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YOL159CYOL159C 516 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 LEE1YPL054W 906 nt1.34□□□□□ -2.19
CSI1Q04368 BEM2YER155C 6504 nt1.34□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 MDS3YGL197W 4464 nt1.34□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YGR265WYGR265W 411 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PAU18YLL064C 363 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 CLU1YMR012W 3834 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YNL114CYNL114C 372 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YNL324WYNL324W 396 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RPL32YBL092W 393 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 MRPL50YNR022C 420 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PAU6YNR076W 363 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 MSH5YDL154W 2706 nt1.33□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 SWF1YDR126W 1011 nt1.32□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YLR434CYLR434C 384 nt1.32□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RRT1YBL048W 312 nt1.32□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 HCH1YNL281W 462 nt1.32□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 MAK10YEL053C 2202 nt1.32□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PMD1YER132C 5262 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RSM22YKL155C 1887 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 AGA2YGL032C 264 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PHS1YJL097W 654 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 DGR2YKL121W 2559 nt1.31□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YDR008CYDR008C 351 nt1.3□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YDR269CYDR269C 324 nt1.3□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RPS24BYIL069C 408 nt1.3□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RRT15YLR162W-A 189 nt1.3□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 DIE2YGR227W 1578 nt1.3□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 ROM2YLR371W 4071 nt1.29□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YGL239CYGL239C 315 nt1.29□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PBY1YBR094W 2262 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 SRP14YDL092W 441 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YHR138CYHR138C 345 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YKL063CYKL063C 504 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YKL202WYKL202W 582 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 RPL26AYLR344W 384 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 YBR285WYBR285W 435 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 MVP1YMR004W 1536 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 PIP2YOR363C 2991 nt1.28□□□□□ -2.2
CSI1Q04368 UFD2YDL190C 2886 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 AZF1YOR113W 2745 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YDL011CYDL011C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YPL185WYPL185W 396 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 TOF2YKR010C 2316 nt1.27□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 MUK1YPL070W 1839 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 PXA2YKL188C 2562 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 APL2YKL135C 2181 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YAP6YDR259C 1152 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YFL019CYFL019C 354 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YOR376WYOR376W 369 nt1.26□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 SWI5YDR146C 2130 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 RPL40BYKR094C 387 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YPL182CYPL182C 384 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YAR009CYAR009C 3591 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.25□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YSY6YBR162W-A 198 nt1.24□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 HDA3YPR179C 1968 nt1.24□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 SPT7YBR081C 3999 nt1.23□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 CDC36YDL165W 576 nt1.23□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.23□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 NST1YNL091W 3723 nt1.23□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 TIM13YGR181W 318 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 ISF1YMR081C 1017 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 YOP1YPR028W 543 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 SEC3YER008C 4011 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 ZRG17YNR039C 1818 nt1.22□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 RAD9YDR217C 3930 nt1.21□□□□□ -2.21
CSI1Q04368 PCF11YDR228C 1881 nt1.21□□□□□ -2.22
CSI1Q04368 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms