Protein–RNA interactions for Protein: Q04004

PLP1, Phosducin-like protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PLP1Q04004 YDR114CYDR114C 303 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 SPC2YML055W 537 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 CSM4YPL200W 471 nt0.47□□□□□ -2.33
PLP1Q04004 YLR271WYLR271W 825 nt0.46□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 SLY1YDR189W 2001 nt0.46□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 TMA22YJR014W 597 nt0.45□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YPR096CYPR096C 303 nt0.45□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YPR153WYPR153W 423 nt0.45□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 POP7YBR167C 423 nt0.45□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 PAC1YOR269W 1485 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 MRPL32YCR003W 552 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 snR5snR5 204 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 PRE4YFR050C 801 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YGL015CYGL015C 393 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 ECM12YHR021W-A 456 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 LCD1YDR499W 2244 nt0.44□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 ALG13YGL047W 609 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YGR042WYGR042W 816 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 UPS1YLR193C 528 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YAR009CYAR009C 3591 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 APL2YKL135C 2181 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YSP1YHR155W 3687 nt0.43□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 MMS4YBR098W 2076 nt0.42□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YJR079WYJR079W 330 nt0.42□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.42□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YBR071WYBR071W 636 nt0.42□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YGR115CYGR115C 780 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YGR228WYGR228W 345 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 IES4YOR189W 351 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 BFR2YDR299W 1605 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 DBP6YNR038W 1890 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 WAR1YML076C 2835 nt0.41□□□□□ -2.34
PLP1Q04004 MET32YDR253C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YPT6YLR262C 648 nt0.39□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 RRT1YBL048W 312 nt0.39□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YLL032CYLL032C 2478 nt0.38□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.38□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 SDS22YKL193C 1017 nt0.38□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 ISD11YER048W-A 285 nt0.37□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 ABF2YMR072W 552 nt0.37□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 PAN2YGL094C 3348 nt0.37□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 MND1YGL183C 660 nt0.36□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YIL059CYIL059C 366 nt0.36□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 VAM3YOR106W 852 nt0.36□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 GMC2YLR445W 567 nt0.35□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YCL002CYCL002C 792 nt0.35□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 CHS6YJL099W 2241 nt0.35□□□□□ -2.35
PLP1Q04004 YGL230CYGL230C 444 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 MRPL31YKL138C 396 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 RPL32YBL092W 393 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YOR248WYOR248W 303 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 SLI15YBR156C 2097 nt0.34□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 GEA2YEL022W 4380 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 PMP1YCR024C-A 123 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YHL042WYHL042W 453 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 URM1YIL008W 300 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YMR254CYMR254C 309 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YMR160WYMR160W 2451 nt0.33□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.32□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 SCEIQ0160 708 nt0.32□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 MRPS8YMR158W 468 nt0.32□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 OST1YJL002C 1431 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 FMP27YLR454W 7887 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 RFX1YLR176C 2436 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 NPC2YDL046W 522 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 LOA1YPR139C 903 nt0.31□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 PPN1YDR452W 2025 nt0.3□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 NOP9YJL010C 2001 nt0.3□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YJR003CYJR003C 1560 nt0.3□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 COG4YPR105C 2586 nt0.3□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YCR100CYCR100C 951 nt0.29□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 snR9snR9 187 nt0.29□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 SPO11YHL022C 1197 nt0.29□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.29□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YBR063CYBR063C 1215 nt0.29□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YDL187CYDL187C 330 nt0.28□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YOR029WYOR029W 336 nt0.28□□□□□ -2.36
PLP1Q04004 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.27□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 INA22YIR024C 651 nt0.27□□□□□ -2.37
PLP1Q04004 NPR2YEL062W 1848 nt0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78 ms