Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID5AQ03989 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID5AQ03989 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms