Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB1Q02818 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB1Q02818 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms