Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NHLH2Q02577 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms