Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSC2Q02487 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms