Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC6A3Q01959 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A3Q01959 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms