Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
E2F1Q01094 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F1Q01094 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms