Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFAMQ00059 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms