Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR1P84550 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms