Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTNAP1P78357 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP1P78357 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms