Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIP4K2BP78356 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2BP78356 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms