Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIPK4P57078 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms