Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEMP55040 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEMP55040 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEMP55040 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEMP55040 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEMP55040 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEMP55040 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEMP55040 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms