Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDST1P52848 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDST1P52848 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDST1P52848 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDST1P52848 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDST1P52848 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDST1P52848 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDST1P52848 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDST1P52848 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms