Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC3P51654 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC3P51654 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPC3P51654 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC3P51654 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms