Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DAP3P51398 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DAP3P51398 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms